MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta

Total Repeats: 934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007111	GGT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007111	TAA	2	6	37	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007111	TAC	2	6	98	103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007111	TTTGT	2	10	115	124	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007111	CCT	2	6	145	150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007111	AT	3	6	295	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007111	AT	3	6	316	321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007111	GAG	3	9	333	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007111	CTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007111	CTA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007111	AT	3	6	430	435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007111	CAG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007111	CTAT	2	8	618	625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007111	TA	3	6	780	785	50 %	50 %	0 %	0 %	67459863
15	NC_007111	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459863
16	NC_007111	CTTT	2	8	982	989	0 %	75 %	0 %	25 %	67459863
17	NC_007111	TA	3	6	1031	1036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007111	AT	3	6	1111	1116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007111	T	6	6	1153	1158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007111	TAA	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007111	A	7	7	1201	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007111	TA	3	6	1212	1217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007111	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007111	ATT	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
25	NC_007111	AGT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459864
26	NC_007111	TAA	2	6	1425	1430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
27	NC_007111	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
28	NC_007111	ATA	2	6	1493	1498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459864
29	NC_007111	TTAT	2	8	1506	1513	25 %	75 %	0 %	0 %	67459864
30	NC_007111	A	7	7	1537	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	67459864
31	NC_007111	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	67459864
32	NC_007111	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
33	NC_007111	ATT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459864
34	NC_007111	GTAT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007111	TAT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007111	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007111	AAT	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007111	GT	3	6	1817	1822	0 %	50 %	50 %	0 %	67459865
39	NC_007111	ATT	2	6	1864	1869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
40	NC_007111	AAT	2	6	1872	1877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
41	NC_007111	GGT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	67459865
42	NC_007111	CTA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459865
43	NC_007111	TA	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
44	NC_007111	A	7	7	1939	1945	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
45	NC_007111	TA	3	6	1995	2000	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
46	NC_007111	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
47	NC_007111	AGAT	2	8	2057	2064	50 %	25 %	25 %	0 %	67459865
48	NC_007111	TAA	2	6	2067	2072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
49	NC_007111	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
50	NC_007111	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
51	NC_007111	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459865
52	NC_007111	AGAA	2	8	2184	2191	75 %	0 %	25 %	0 %	67459865
53	NC_007111	A	7	7	2217	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
54	NC_007111	GATTAT	2	12	2224	2235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	67459865
55	NC_007111	CCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	67459865
56	NC_007111	AT	3	6	2284	2289	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
57	NC_007111	AAT	2	6	2301	2306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
58	NC_007111	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
59	NC_007111	T	6	6	2398	2403	0 %	100 %	0 %	0 %	67459865
60	NC_007111	A	6	6	2409	2414	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
61	NC_007111	A	7	7	2426	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
62	NC_007111	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	67459865
63	NC_007111	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
64	NC_007111	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
65	NC_007111	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	67459865
66	NC_007111	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459865
67	NC_007111	TTA	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459865
68	NC_007111	AAAT	2	8	2631	2638	75 %	25 %	0 %	0 %	67459866
69	NC_007111	TAG	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459866
70	NC_007111	AAT	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
71	NC_007111	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
72	NC_007111	TTA	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
73	NC_007111	AAT	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459866
74	NC_007111	AAC	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459866
75	NC_007111	ATT	2	6	2798	2803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
76	NC_007111	TTA	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459866
77	NC_007111	A	7	7	2902	2908	100 %	0 %	0 %	0 %	67459866
78	NC_007111	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	67459866
79	NC_007111	TAT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007111	T	6	6	2991	2996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007111	A	6	6	3007	3012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007111	TAAA	2	8	3015	3022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007111	TGT	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007111	T	6	6	3060	3065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007111	AT	3	6	3088	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007111	A	6	6	3104	3109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007111	AAAATT	2	12	3125	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007111	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007111	AGAT	2	8	3199	3206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007111	ATAG	2	8	3297	3304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007111	TAAA	2	8	3336	3343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007111	T	7	7	3385	3391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007111	A	6	6	3394	3399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007111	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
95	NC_007111	GA	3	6	3688	3693	50 %	0 %	50 %	0 %	67459867
96	NC_007111	TCTAAA	2	12	3703	3714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459867
97	NC_007111	AGA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
98	NC_007111	TA	4	8	3759	3766	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
99	NC_007111	AAT	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
100	NC_007111	TAC	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
101	NC_007111	ATTTA	2	10	3861	3870	40 %	60 %	0 %	0 %	67459867
102	NC_007111	TCAG	2	8	3912	3919	25 %	25 %	25 %	25 %	67459867
103	NC_007111	ACA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
104	NC_007111	TTA	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
105	NC_007111	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
106	NC_007111	GTA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
107	NC_007111	ATT	2	6	4166	4171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
108	NC_007111	AAATTC	2	12	4179	4190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	67459867
109	NC_007111	CAT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
110	NC_007111	CAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
111	NC_007111	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
112	NC_007111	TTA	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
113	NC_007111	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
114	NC_007111	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	67459867
115	NC_007111	ATG	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459867
116	NC_007111	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
117	NC_007111	TTA	2	6	4462	4467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
118	NC_007111	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
119	NC_007111	CCT	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	67459867
120	NC_007111	TA	3	6	4598	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
121	NC_007111	ATA	3	9	4622	4630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
122	NC_007111	TAA	2	6	4632	4637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
123	NC_007111	TA	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
124	NC_007111	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
125	NC_007111	TAC	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459867
126	NC_007111	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
127	NC_007111	TTA	2	6	4909	4914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
128	NC_007111	ACA	2	6	5029	5034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
129	NC_007111	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459867
130	NC_007111	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	67459867
131	NC_007111	ACAA	2	8	5212	5219	75 %	0 %	0 %	25 %	67459867
132	NC_007111	ATA	2	6	5222	5227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
133	NC_007111	AGCG	2	8	5266	5273	25 %	0 %	50 %	25 %	67459867
134	NC_007111	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
135	NC_007111	A	6	6	5395	5400	100 %	0 %	0 %	0 %	67459867
136	NC_007111	AATGA	2	10	5422	5431	60 %	20 %	20 %	0 %	67459867
137	NC_007111	AAGAG	2	10	5556	5565	60 %	0 %	40 %	0 %	67459867
138	NC_007111	CAA	2	6	5651	5656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	67459867
139	NC_007111	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	67459867
140	NC_007111	ATTA	2	8	5725	5732	50 %	50 %	0 %	0 %	67459867
141	NC_007111	ATT	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	67459867
142	NC_007111	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459868
143	NC_007111	ACAA	2	8	5854	5861	75 %	0 %	0 %	25 %	67459868
144	NC_007111	GTA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	67459868
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411	NC_007111	AGTT	2	8	16587	16594	25 %	50 %	25 %	0 %	67459878
412	NC_007111	AG	3	6	16654	16659	50 %	0 %	50 %	0 %	67459878
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415	NC_007111	GAA	2	6	16740	16745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	67459878
416	NC_007111	TAC	2	6	16777	16782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	67459878
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